荧光显微系统质量评估应用分享第12期:重定位精度以及伪影观察

2023-07-24

Argolight荧光定量标准片是专门为荧光显微系统的性能评估、参数验证、校准和监控而设计的。它包含多种二维和三维的荧光图案。

 

本系列文章是针对Argolight荧光定量标准片中的每个荧光图案进行部分应用案例的分享。其中一些应用可以通过Argolight配套的图像处理软件“Daybook”完成,有一些则可以通过人类视觉或其他辅助软件进行分析。具体请联系西诺光学,见文末联系方式。

 

以下内容将为大家分享Argolight荧光定量标准片中“定位十字叉”用于重定位精度,以及“几何图案”用于伪影观察的案例分享。

 

 

“定位十字叉”图案

 图1:Argo-SIM:“定位十字叉”长度为20μm

 

“几何”图案Argo-SIM v2.0

图2:Argo-SIM:中的各种几何图案

 

 

重定位精度

 

问题:载物台的重定位精度对于图像拼接非常重要。厂家一般会提供与载物台相关的重定位误差。

 

我们可通过以下方式轻松检查:

  • 将包含已知信息的对象置于视野中心(例如“定位十字叉”),
  • 在不同方向上来回移动样品,
  • 每次样本返回其初始位置时获取图像。

 

叠加图像并在每个图像中检测观察对象的质心,确定空间偏移,然后检查偏移是否在规范范围内。

 

实例:图3显示了载物台在X和Y方向上来回移动后返回初始位置的“定位十字叉”的图像叠加。

可以观察到,载物台的重定位精度要比厂家提供的5μm精度大很多。

 

图3:(a)X和Y方向上往返后“定位十字叉”的图像叠加。(b) 系统的重定位精度在精度范围靶面上的位置,可以跟厂家给出的值5μm作对比,显示实验真实的精度。

 

物镜检测

 

问题:物镜前透镜上的灰尘和干掉的油渍,以及其他损坏例如划痕会明显改变图像质量。

 

因此,建议在开始任何成像实验之前,先检查物镜是否存在此类问题。

 

该检查的一种简单而快速的方法是通过目镜观察“定位十字叉”。当然,此类检查取决于用户的体验,在使用Argolight荧光定量标准片一段时间后,可能会很快发现这些问题。

实例:图4显示了“定位十字叉”的Z-stack的XY和XZ正交视图。63×/1.4平场复消色差油物镜的前透镜上有污渍(干掉的油渍或灰尘),之后进行了清洁。

 

通过模糊的XY图像和Z轴方向的扩散来证明污渍的存在。这个简单的测试可以提供有关物镜清洁度的信息。

 

图4:Argo-HM;(a,c)XY和(b,d)XZ视图,来自使用63×/1.4平场复消色差油物镜获取的共聚焦显微镜图像的Z-stack,(a,b)前透镜上有污渍,(c,d)清洁污渍之后。污渍的存在通过更模糊的XY图像和Z轴更大的扩散来证明。图片由Friedrich Miescher生物医学研究所的Laurent Gelman拍摄。

 

伪影观察

 

问题:一些成像技术,如结构照明超分辨显微镜(SIM),需要使用专门的算法从一组原始图像中获得重建的超分辨率图像。

 

然而,根据原始图像的信噪比,这些专用算法可能会在重建图像中引入伪影[1]。

 

“几何图形”允许评估SIM重建算法的精度,并观察它们可能引入的伪影。

 

实例:图5显示了用SIM采集的16臂星和七边形的归一化图像。

 

从16臂星的两臂之间以及七边形内部的重建中可以观察到清晰的伪影。

图5:Argo SIM;用63×/1.4平场复消色差油物镜在GFP通道上采集的16臂星和七边形的结构照明显微镜(SIM)图像。可以观察到重建算法伪影。图像由哈佛医学院细胞生物学显微镜设施的Talley Lambert采集。

 

以上是本期关于“定位十字叉”用于重定位精度和物镜清洁程度检测,以及“几何图案”用于伪影观察的案例的分享,下周第13期将为大家分享更多其他图样的应用案例。请大家持续关注“Sinoptix”微信公众号。